Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EDEM3Q9BZQ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDEM3Q9BZQ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms