Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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