Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms