Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms