Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCP2Q9BX26 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP2Q9BX26 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms