Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms