Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms