Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms