Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms