Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms