Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms