Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms