Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms