Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms