Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms