Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms