Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHFRQ96EP1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHFRQ96EP1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms