Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms