Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms