Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms