Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF1Q92879 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms