Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms