Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms