Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms