Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms