Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms