Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC71Q8N4P6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms