Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NME9Q86XW9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms