Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms