Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC46A3Q7Z3Q1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms