Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L1Q7RTZ2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L1Q7RTZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms