Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HS2ST1Q7LGA3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms