Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT62

BARGIN, Bargin, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARGINQ6ZT62 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARGINQ6ZT62 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARGINQ6ZT62 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms