Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms