Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms