Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LLGL2Q6P1M3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms