Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUSC1-AS1Q66K80 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms