Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms