Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms