Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP170Q5SW79 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP170Q5SW79 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP170Q5SW79 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP170Q5SW79 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CEP170Q5SW79 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms