Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC39AQ5SRH9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC39AQ5SRH9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms