Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SAMD9Q5K651 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SAMD9Q5K651 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SAMD9Q5K651 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SAMD9Q5K651 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SAMD9Q5K651 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SAMD9Q5K651 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SAMD9Q5K651 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms