Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms