Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRDTQ58F21 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms