Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms