Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms