Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ODF3L2Q3SX64 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms