Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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