Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms