Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms